下面是详细分析：
结石可直接引起肾脏、输尿管、膀胱和尿道损伤。较大或表面粗糙的结石容易造成肾脏或膀胱黏膜糜烂、溃疡出血，甚至引起自发性肾破裂、肾瘘。结石长期刺激黏膜可能引起鳞状上皮癌，如肾盂癌、膀胱癌等。
正常肾盂和肾盏被覆的移行上皮细胞为3～5层。结石可引起不同程度的上皮增生，细胞层次增多，亦可有不同程度的不典型增生。移行上皮亦可同固有膜内增生，形成实体的细胞巢。细胞巢保持基底膜完整，继续发展上皮巢可与表层上皮分离，形成孤立的上皮团，称VonBrunn巢。这种巢中央可出现腔隙，甚至成囊状。囊的上皮为立方或柱状上皮，囊内可有黏液，这种病变诊断为囊性肾盂炎。有时上皮向肠上皮分化，且有黏液分泌，称腺性肾盂炎。
在肾结石和感染刺激下，肾盂移行上皮常发生鳞状上皮化生，常为灶性化生，不如膀胱发生鳞伏上皮化生那样广泛。化生的上皮亦可有增生和不典型增生。
肾结石合并癌少见，可合并鳞状细胞癌和移行细胞癌。鳞状细胞癌常与较大的结石如鹿角状结石、多发性结石、肾盂积水合并。鳞状细胞癌的肾脏多无功能，病人预后差。肾结石病人合并移行细胞癌的发病率并没有明显增高。
肾结石不治疗的危害
可能发生肾绞痛，肾结石最典型的症状即反复发作肾绞痛。绞痛往往突然发作，而且还不时地加剧，剧烈的疼痛常使患者面色苍白、大汗淋漓。病人还常伴有血压下降、恶心、呕吐等症状，疼痛一般局限于肾区。肾结石另外一个常见的症状为血尿。血尿分为肉眼血尿与显微镜下血尿，其特点是先疼痛后有血尿。所以患者应该及时的进行肾结石的治疗方法的选择，及时治好肾结石。
尿路梗阻引起肾功能减退也是肾结石不治疗的危害：当双侧肾结石引起双侧完全性尿路梗阻时，还可致无尿甚至是急慢性肾功能衰竭、尿毒症。
肾结石的危害还可能并发尿路感染，由肾结石引发的并发症也较多见。如结石并发感染时患者可有尿急、尿频、尿痛等症状，尿液检查多可见脓细胞;当继发急性肾盂肾炎时病人可有发热、畏寒等全身症状；结石堵塞尿路时，则可引起肾积水。
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